ההשפעות של BPA תלויות במנגנונים מולקולריים ואפיגנטיים שונים המכתיבים האם המערכת האנדוקרינית או מערכת הרבייה מושפעת, כאשר החשש המרכזי הוא כי נגעים שפירים שקיימים עלולים להפוך לסרטניים